רוברט לנגדון, מומחה לסמלים, מקבל שיחת טלפון בהולה בשעת לילה מאוחרת. האוצר הזקן של הלובר נרצח במוזיאון, וחוקרי המשטרה מצאו צופן סתום ליד גופתו. כשלנגדון מנסה לפענח את הצופן המוזר, הוא נדהם לגלות שהוא מוביל לשורה של רמזים ביצירותיו של דה וינצ'י, רמזים גלויים לעין כול, שהוסוו בחכמה על ידי הצייר.
לנגדון חובר למפענחת הצפנים המחוננת סופי נווה, וביחד הם מגלים שהאוצר המנוח היה חבר ב"מסדר ציון" - אגודה מסתורית שבין חבריה נמנו אייזק ניוטון, בוטיצ'לי, ויקטור הוגו וליאונרדו דה וינצ'י – ושהוא ככל הנראה הקריב את חייו כדי לשמור על סודו של המסדר. לנגדון ונווה מוצאים עצמם במירוץ מטורף ברחובות פריז ולונדון, כשהם מתמודדים מול גורמים חסרי פנים אבל רבי עוצמה. עד מהרה הם מבינים כי אם לא יפענחו את הצופן, יאבד לנצח סודו של המסדר - ואתו אמת היסטורית מדהימה.

מאז צאתו לאור לפני חמש עשרה שנים נמכר צופן דה-וינצ'י בלמעלה משמונים מיליון עותקים, תורגם ל־44 שפות, ועובד לסרט קולנוע מצליח. וביצר את מעמדו של דן בראון כאחד מגדולי הסופרים בני זמננו והוא אחד הספרים המצוטטים והמשפיעים ביותר.